从众多的生物节律现象可看出，动物、植物的生理机能和生活习性好象受体内某种内在的时钟控制，这种神秘的时钟称为“生物钟”，即生物感知时间的能力。而生物节律实际上是由生物钟控制的，是生物钟的外在表现。

它们的区别在于:

生物钟属于已经养成习惯了的，而时钟却是根据人自身的需要，去调整的，比如：我到了另一个国家，那时间必定有差别，那我就会调整它，让它调到让我满意的时间：如果我每天都是7点钟起床，那我已经养成了习惯，即使不用上闹钟我也可以起床。